Seminar 20dec2018. Bioinformatics. Classification of tuberculosis samples

Hugo-Olivia-logos

Seminar 20dec2018. Bioinformatics. Classification of tuberculosis samples

The seminar will be held on Thursday 20th of December of 2018 at 10  AM, at Sala de Conferencias CACTI (Torre CACTI-Planta 0).

Tittle: “ Clasificación de muestras de tuberculosis: un ejemplo de colaboración entre grupos del CINBIO”

The speaker will be Dr. Hugo López-Fernández from “SI4-SING Next Generation Computer Systems Group”. Also, Olivia Estévez, from the Immunology group, will introduce the biological aspects of the collaboration.

The talk will be in spanish. No registration is required.

Abstract:La tuberculosis (TB) es la enfermedad infecciosa que más muertes causa cada año. A pesar de que se han llevado a cabo muchos esfuerzos para entender la enfermedad, la resistencia o susceptibilidad a una infección por Mycobacterium tuberculosis está todavía lejos de ser entendida completamente. Este seminario tiene como objetivo presentar una colaboración, llevada a cabo entre los grupos de Inmunología y Sistemas Informáticos de Nueva Generación (SING) del CINBIO, con el objetivo de identificar tipos de respuesta inmune en personas sanas no infectadas (No-TBI), contactos o personas con la enfermedad latente (LTBI) y personas con la enfermedad activa (TB). Para ello, se analiza la expresión diferencial entre grupos utilizando datos de RNA-Seq y posteriormente se aplican técnicas de aprendizaje automático (machine learning) con el fin de saber hacer una clasificación de los pacientes LTBI. Además de mostrar algunos resultados preliminares, el seminario se centrará en los aspectos más importantes de la colaboración y tratará de dar algunos consejos o pautas acerca del uso de ciertas herramientas de análisis de datos y la aplicación de técnicas de machine learning.

Next Seminars:

10th of January 2019 TNT. Team Nanotech